РФПЛ, объединяющая профессиональные клубы отечественной премьер-лиги, зародилась в 2001 году. Первыми членами организации стали 16 команд, которые выступали в чемпионате-2002. Каждый год вылетающие из элиты коллективы теряют членство в РФПЛ и, напротив, повысившиеся в статусе клубы становятся новыми членами.
Основателями РФПЛ являются пять клубов: ЦСКА, «Динамо», «Зенит», «Локомотив» и «Спартак». Они не прекращали членство, попросту говоря, не вылетали в первый дивизион. Исключение составляют «Крылья Советов», также стоявшие у истоков Объединения, но по итогам сезона-2013/14 самарцы понизились в классе. За историю существования членство в РФПЛ в общей сложности получили 32 клуба.
Суть организации заложена в названии - Российская футбольная Премьер-Лига занимается непосредственным проведением чемпионата России по футболу. Ранее данные функции были возложены на Профессиональную футбольную лигу (ПФЛ). Основным решением организации стало стремление соответствовать европейскому календарю, вызвавшее переход российского футбола на систему «осень-весна». Переходный турнир по схеме «весна-осень-весна» состоялся в 2011/2012 годах, после чего окончательно идет в ногу с ведущими чемпионатами Европы.
Первым президентом РФПЛ являлся Виталий Мутко. В 2007 году возглавил ведомство Сергей Прядкин. Три года спустя Прядкина единогласно переизбрали и увеличили срок полномочий на пять лет. Президент Объединения не возражает против расширения премьер-лиги до 18 клубов - такая инициатива неоднократно выдвигалась и обсуждалась. Но Прядкин настаивает на финансовой стабильности клубов, желательно наличие частного инвестора, что позволит избежать неожиданных снятий команд с турнира. В недавнем прошлом были вынуждены объявить о расформировании из-за отсутствия средств ФК «Москва» и «Сатурн». Пока вопрос об увеличении числа участников элитного дивизиона остается открытым.
